蝙蝠科:翼手目中最大的一科，較不具有明顯特化的鼻吻特徵，共有15屬29種
在臺灣目前可歸分4大群，彩蝠亞科(Kerivoulinae)、管鼻蝠亞科(Murininae)、鼠耳蝠亞科(Myotinae)、蝙蝠亞科(Vespertilioninae)
彩蝠亞科(Kerivoulinae)
管鼻蝠亞科(Murininae)
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鼠耳蝠亞科(Myotinae)
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蝙蝠亞科(Vespertilioninae)
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